Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMB4P28070 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSMB4P28070 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSMB4P28070 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PSMB4P28070 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PSMB4P28070 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms