Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

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Length 886 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDE4AP27815 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDE4AP27815 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
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