Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ITGA3P26006 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ITGA3P26006 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms