Protein–RNA interactions for Protein: P25786

PSMA1, Proteasome subunit alpha type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA1P25786 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMA1P25786 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMA1P25786 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMA1P25786 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMA1P25786 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMA1P25786 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMA1P25786 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMA1P25786 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMA1P25786 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMA1P25786 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMA1P25786 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMA1P25786 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMA1P25786 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMA1P25786 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMA1P25786 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMA1P25786 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMA1P25786 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMA1P25786 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMA1P25786 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMA1P25786 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMA1P25786 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMA1P25786 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMA1P25786 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMA1P25786 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMA1P25786 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMA1P25786 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMA1P25786 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMA1P25786 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMA1P25786 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMA1P25786 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMA1P25786 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMA1P25786 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMA1P25786 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMA1P25786 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMA1P25786 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMA1P25786 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMA1P25786 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMA1P25786 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMA1P25786 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMA1P25786 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMA1P25786 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMA1P25786 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMA1P25786 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMA1P25786 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMA1P25786 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMA1P25786 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMA1P25786 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMA1P25786 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMA1P25786 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMA1P25786 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMA1P25786 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMA1P25786 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMA1P25786 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PSMA1P25786 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PSMA1P25786 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMA1P25786 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMA1P25786 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMA1P25786 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMA1P25786 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMA1P25786 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMA1P25786 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMA1P25786 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMA1P25786 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMA1P25786 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMA1P25786 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMA1P25786 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMA1P25786 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMA1P25786 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMA1P25786 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMA1P25786 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMA1P25786 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMA1P25786 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMA1P25786 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMA1P25786 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMA1P25786 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMA1P25786 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMA1P25786 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMA1P25786 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMA1P25786 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMA1P25786 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMA1P25786 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMA1P25786 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PSMA1P25786 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMA1P25786 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMA1P25786 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMA1P25786 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMA1P25786 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMA1P25786 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMA1P25786 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMA1P25786 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMA1P25786 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMA1P25786 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMA1P25786 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMA1P25786 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMA1P25786 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMA1P25786 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMA1P25786 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMA1P25786 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMA1P25786 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PSMA1P25786 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms