Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
YY1P25490 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
YY1P25490 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
YY1P25490 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
YY1P25490 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
YY1P25490 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
YY1P25490 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
YY1P25490 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
YY1P25490 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
YY1P25490 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
YY1P25490 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
YY1P25490 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
YY1P25490 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
YY1P25490 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
YY1P25490 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
YY1P25490 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
YY1P25490 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
YY1P25490 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
YY1P25490 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
YY1P25490 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
YY1P25490 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
YY1P25490 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
YY1P25490 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
YY1P25490 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
YY1P25490 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
YY1P25490 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
YY1P25490 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
YY1P25490 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
YY1P25490 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
YY1P25490 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
YY1P25490 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
YY1P25490 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
YY1P25490 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
YY1P25490 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
YY1P25490 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
YY1P25490 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
YY1P25490 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
YY1P25490 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
YY1P25490 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
YY1P25490 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
YY1P25490 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
YY1P25490 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
YY1P25490 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
YY1P25490 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
YY1P25490 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
YY1P25490 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
YY1P25490 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
YY1P25490 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
YY1P25490 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
YY1P25490 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
YY1P25490 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
YY1P25490 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
YY1P25490 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
YY1P25490 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
YY1P25490 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
YY1P25490 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
YY1P25490 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
YY1P25490 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
YY1P25490 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
YY1P25490 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
YY1P25490 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
YY1P25490 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
YY1P25490 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
YY1P25490 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
YY1P25490 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
YY1P25490 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
YY1P25490 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
YY1P25490 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
YY1P25490 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
YY1P25490 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
YY1P25490 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
YY1P25490 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
YY1P25490 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
YY1P25490 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
YY1P25490 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
YY1P25490 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
YY1P25490 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
YY1P25490 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
YY1P25490 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
YY1P25490 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
YY1P25490 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
YY1P25490 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
YY1P25490 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
YY1P25490 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
YY1P25490 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
YY1P25490 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
YY1P25490 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
YY1P25490 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
YY1P25490 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
YY1P25490 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
YY1P25490 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
YY1P25490 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
YY1P25490 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
YY1P25490 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
YY1P25490 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
YY1P25490 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
YY1P25490 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
YY1P25490 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
YY1P25490 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
YY1P25490 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms