Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYT1P21579 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SYT1P21579 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SYT1P21579 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SYT1P21579 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYT1P21579 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYT1P21579 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYT1P21579 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYT1P21579 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYT1P21579 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SYT1P21579 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT1P21579 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT1P21579 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT1P21579 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT1P21579 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT1P21579 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT1P21579 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT1P21579 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT1P21579 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT1P21579 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT1P21579 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT1P21579 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT1P21579 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT1P21579 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT1P21579 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT1P21579 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SYT1P21579 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SYT1P21579 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYT1P21579 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYT1P21579 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYT1P21579 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYT1P21579 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYT1P21579 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYT1P21579 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYT1P21579 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYT1P21579 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYT1P21579 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYT1P21579 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SYT1P21579 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYT1P21579 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYT1P21579 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYT1P21579 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SYT1P21579 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYT1P21579 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYT1P21579 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYT1P21579 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYT1P21579 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYT1P21579 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYT1P21579 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYT1P21579 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYT1P21579 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYT1P21579 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYT1P21579 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYT1P21579 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYT1P21579 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYT1P21579 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYT1P21579 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYT1P21579 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYT1P21579 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SYT1P21579 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYT1P21579 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYT1P21579 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYT1P21579 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYT1P21579 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYT1P21579 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYT1P21579 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYT1P21579 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYT1P21579 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYT1P21579 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYT1P21579 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYT1P21579 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYT1P21579 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYT1P21579 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SYT1P21579 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYT1P21579 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYT1P21579 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYT1P21579 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYT1P21579 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYT1P21579 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYT1P21579 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYT1P21579 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYT1P21579 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYT1P21579 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYT1P21579 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SYT1P21579 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYT1P21579 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYT1P21579 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYT1P21579 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYT1P21579 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYT1P21579 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYT1P21579 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SYT1P21579 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYT1P21579 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYT1P21579 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYT1P21579 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYT1P21579 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYT1P21579 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYT1P21579 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYT1P21579 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SYT1P21579 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms