Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LMNB1P20700 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMNB1P20700 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms