Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPI1P17947 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPI1P17947 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPI1P17947 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPI1P17947 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPI1P17947 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SPI1P17947 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPI1P17947 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPI1P17947 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SPI1P17947 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPI1P17947 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPI1P17947 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPI1P17947 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPI1P17947 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPI1P17947 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPI1P17947 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPI1P17947 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPI1P17947 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPI1P17947 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPI1P17947 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPI1P17947 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPI1P17947 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SPI1P17947 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPI1P17947 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPI1P17947 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPI1P17947 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SPI1P17947 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPI1P17947 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPI1P17947 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPI1P17947 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPI1P17947 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPI1P17947 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPI1P17947 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPI1P17947 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPI1P17947 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPI1P17947 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPI1P17947 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPI1P17947 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPI1P17947 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SPI1P17947 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPI1P17947 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SPI1P17947 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPI1P17947 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SPI1P17947 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPI1P17947 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPI1P17947 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPI1P17947 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPI1P17947 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPI1P17947 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPI1P17947 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPI1P17947 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPI1P17947 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPI1P17947 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPI1P17947 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPI1P17947 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SPI1P17947 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPI1P17947 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPI1P17947 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPI1P17947 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPI1P17947 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPI1P17947 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPI1P17947 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPI1P17947 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPI1P17947 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPI1P17947 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPI1P17947 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPI1P17947 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPI1P17947 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SPI1P17947 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPI1P17947 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPI1P17947 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPI1P17947 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPI1P17947 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPI1P17947 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPI1P17947 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPI1P17947 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPI1P17947 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPI1P17947 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPI1P17947 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPI1P17947 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPI1P17947 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPI1P17947 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPI1P17947 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPI1P17947 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPI1P17947 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPI1P17947 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPI1P17947 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPI1P17947 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SPI1P17947 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPI1P17947 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SPI1P17947 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPI1P17947 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPI1P17947 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPI1P17947 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPI1P17947 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPI1P17947 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPI1P17947 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPI1P17947 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPI1P17947 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SPI1P17947 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms