Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ATP2A2P16615 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ATP2A2P16615 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms