Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GCFC2P16383 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms