Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LAMC1P11047 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LAMC1P11047 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms