Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI8

SAA1, Serum amyloid A-1 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA1P0DJI8 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAA1P0DJI8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAA1P0DJI8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAA1P0DJI8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAA1P0DJI8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAA1P0DJI8 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAA1P0DJI8 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAA1P0DJI8 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SAA1P0DJI8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAA1P0DJI8 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAA1P0DJI8 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAA1P0DJI8 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAA1P0DJI8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAA1P0DJI8 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAA1P0DJI8 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAA1P0DJI8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAA1P0DJI8 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAA1P0DJI8 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAA1P0DJI8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAA1P0DJI8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAA1P0DJI8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAA1P0DJI8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SAA1P0DJI8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SAA1P0DJI8 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAA1P0DJI8 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAA1P0DJI8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAA1P0DJI8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAA1P0DJI8 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAA1P0DJI8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAA1P0DJI8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAA1P0DJI8 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAA1P0DJI8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAA1P0DJI8 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAA1P0DJI8 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAA1P0DJI8 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAA1P0DJI8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAA1P0DJI8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAA1P0DJI8 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAA1P0DJI8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAA1P0DJI8 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SAA1P0DJI8 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
SAA1P0DJI8 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SAA1P0DJI8 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms