Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXB7P09629 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXB7P09629 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms