Protein–RNA interactions for Protein: P08648

ITGA5, Integrin alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA5P08648 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA5P08648 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA5P08648 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA5P08648 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA5P08648 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA5P08648 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA5P08648 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA5P08648 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA5P08648 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA5P08648 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA5P08648 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA5P08648 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA5P08648 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA5P08648 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGA5P08648 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ITGA5P08648 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms