Protein–RNA interactions for Protein: P07498

CSN3, Kappa-casein, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN3P07498 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSN3P07498 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSN3P07498 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSN3P07498 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSN3P07498 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSN3P07498 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSN3P07498 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSN3P07498 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CSN3P07498 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSN3P07498 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CSN3P07498 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSN3P07498 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSN3P07498 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSN3P07498 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSN3P07498 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSN3P07498 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSN3P07498 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CSN3P07498 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSN3P07498 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSN3P07498 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSN3P07498 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSN3P07498 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSN3P07498 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CSN3P07498 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CSN3P07498 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSN3P07498 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSN3P07498 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSN3P07498 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSN3P07498 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSN3P07498 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSN3P07498 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSN3P07498 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSN3P07498 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSN3P07498 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSN3P07498 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSN3P07498 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSN3P07498 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSN3P07498 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSN3P07498 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSN3P07498 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSN3P07498 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CSN3P07498 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSN3P07498 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSN3P07498 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSN3P07498 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSN3P07498 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSN3P07498 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSN3P07498 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSN3P07498 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSN3P07498 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSN3P07498 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSN3P07498 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSN3P07498 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSN3P07498 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSN3P07498 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSN3P07498 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSN3P07498 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSN3P07498 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSN3P07498 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSN3P07498 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSN3P07498 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSN3P07498 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSN3P07498 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSN3P07498 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSN3P07498 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSN3P07498 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSN3P07498 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSN3P07498 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSN3P07498 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSN3P07498 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSN3P07498 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSN3P07498 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CSN3P07498 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSN3P07498 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSN3P07498 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSN3P07498 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSN3P07498 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSN3P07498 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSN3P07498 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CSN3P07498 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSN3P07498 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSN3P07498 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSN3P07498 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSN3P07498 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSN3P07498 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSN3P07498 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSN3P07498 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSN3P07498 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSN3P07498 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CSN3P07498 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSN3P07498 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSN3P07498 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSN3P07498 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSN3P07498 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSN3P07498 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSN3P07498 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSN3P07498 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSN3P07498 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSN3P07498 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CSN3P07498 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms