Protein–RNA interactions for Protein: P07195

LDHB, L-lactate dehydrogenase B chain, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDHBP07195 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LDHBP07195 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LDHBP07195 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LDHBP07195 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LDHBP07195 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LDHBP07195 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LDHBP07195 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LDHBP07195 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LDHBP07195 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LDHBP07195 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LDHBP07195 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LDHBP07195 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LDHBP07195 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LDHBP07195 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LDHBP07195 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LDHBP07195 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LDHBP07195 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LDHBP07195 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LDHBP07195 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LDHBP07195 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LDHBP07195 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LDHBP07195 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LDHBP07195 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LDHBP07195 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LDHBP07195 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LDHBP07195 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LDHBP07195 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LDHBP07195 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LDHBP07195 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LDHBP07195 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LDHBP07195 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LDHBP07195 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LDHBP07195 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LDHBP07195 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LDHBP07195 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LDHBP07195 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LDHBP07195 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LDHBP07195 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LDHBP07195 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LDHBP07195 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LDHBP07195 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LDHBP07195 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LDHBP07195 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LDHBP07195 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LDHBP07195 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LDHBP07195 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LDHBP07195 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LDHBP07195 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LDHBP07195 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LDHBP07195 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LDHBP07195 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LDHBP07195 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LDHBP07195 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LDHBP07195 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LDHBP07195 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LDHBP07195 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LDHBP07195 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LDHBP07195 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LDHBP07195 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LDHBP07195 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LDHBP07195 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LDHBP07195 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LDHBP07195 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LDHBP07195 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LDHBP07195 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LDHBP07195 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LDHBP07195 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LDHBP07195 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LDHBP07195 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LDHBP07195 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LDHBP07195 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LDHBP07195 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LDHBP07195 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LDHBP07195 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LDHBP07195 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LDHBP07195 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LDHBP07195 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LDHBP07195 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LDHBP07195 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LDHBP07195 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LDHBP07195 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LDHBP07195 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LDHBP07195 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LDHBP07195 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LDHBP07195 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LDHBP07195 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LDHBP07195 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LDHBP07195 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LDHBP07195 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LDHBP07195 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LDHBP07195 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LDHBP07195 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LDHBP07195 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LDHBP07195 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LDHBP07195 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LDHBP07195 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LDHBP07195 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LDHBP07195 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LDHBP07195 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LDHBP07195 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms