Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ITGAVP06756 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms