Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYCNP04198 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYCNP04198 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYCNP04198 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYCNP04198 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYCNP04198 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYCNP04198 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MYCNP04198 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYCNP04198 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYCNP04198 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYCNP04198 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYCNP04198 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYCNP04198 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYCNP04198 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYCNP04198 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MYCNP04198 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYCNP04198 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYCNP04198 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MYCNP04198 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYCNP04198 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYCNP04198 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYCNP04198 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYCNP04198 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYCNP04198 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYCNP04198 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYCNP04198 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYCNP04198 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYCNP04198 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MYCNP04198 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MYCNP04198 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
MYCNP04198 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYCNP04198 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYCNP04198 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYCNP04198 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYCNP04198 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYCNP04198 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MYCNP04198 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYCNP04198 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYCNP04198 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYCNP04198 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYCNP04198 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYCNP04198 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYCNP04198 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYCNP04198 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYCNP04198 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYCNP04198 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYCNP04198 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYCNP04198 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYCNP04198 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYCNP04198 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYCNP04198 SLC14A1-206ENST00000535474 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYCNP04198 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYCNP04198 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYCNP04198 MAP3K14-205ENST00000617331 1049 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYCNP04198 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYCNP04198 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYCNP04198 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYCNP04198 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYCNP04198 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MYCNP04198 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYCNP04198 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYCNP04198 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYCNP04198 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYCNP04198 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MYCNP04198 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYCNP04198 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYCNP04198 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYCNP04198 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MYCNP04198 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYCNP04198 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYCNP04198 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYCNP04198 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYCNP04198 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYCNP04198 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYCNP04198 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYCNP04198 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYCNP04198 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYCNP04198 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYCNP04198 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MYCNP04198 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYCNP04198 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYCNP04198 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYCNP04198 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYCNP04198 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYCNP04198 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYCNP04198 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYCNP04198 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYCNP04198 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYCNP04198 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYCNP04198 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYCNP04198 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MYCNP04198 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYCNP04198 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MYCNP04198 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYCNP04198 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYCNP04198 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYCNP04198 AC114550.1-202ENST00000522661 643 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYCNP04198 Metazoa_SRP.12-201ENST00000553249 268 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MYCNP04198 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MYCNP04198 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms