Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VTNP04004 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VTNP04004 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VTNP04004 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VTNP04004 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VTNP04004 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VTNP04004 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VTNP04004 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VTNP04004 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VTNP04004 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VTNP04004 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VTNP04004 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VTNP04004 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VTNP04004 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VTNP04004 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VTNP04004 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VTNP04004 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
VTNP04004 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VTNP04004 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VTNP04004 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VTNP04004 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VTNP04004 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VTNP04004 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VTNP04004 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VTNP04004 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VTNP04004 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VTNP04004 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VTNP04004 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
VTNP04004 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VTNP04004 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.07
VTNP04004 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VTNP04004 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VTNP04004 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VTNP04004 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VTNP04004 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VTNP04004 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
VTNP04004 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VTNP04004 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VTNP04004 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VTNP04004 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VTNP04004 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VTNP04004 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VTNP04004 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VTNP04004 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VTNP04004 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VTNP04004 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VTNP04004 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VTNP04004 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VTNP04004 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
VTNP04004 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VTNP04004 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VTNP04004 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VTNP04004 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VTNP04004 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
VTNP04004 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VTNP04004 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VTNP04004 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VTNP04004 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VTNP04004 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VTNP04004 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
VTNP04004 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VTNP04004 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VTNP04004 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VTNP04004 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VTNP04004 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VTNP04004 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VTNP04004 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VTNP04004 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VTNP04004 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VTNP04004 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VTNP04004 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VTNP04004 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VTNP04004 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VTNP04004 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VTNP04004 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VTNP04004 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VTNP04004 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VTNP04004 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
VTNP04004 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VTNP04004 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VTNP04004 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VTNP04004 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VTNP04004 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VTNP04004 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VTNP04004 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VTNP04004 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VTNP04004 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VTNP04004 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
VTNP04004 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VTNP04004 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VTNP04004 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
VTNP04004 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VTNP04004 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VTNP04004 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
VTNP04004 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VTNP04004 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VTNP04004 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VTNP04004 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VTNP04004 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VTNP04004 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms