Protein–RNA interactions for Protein: O96008

TOMM40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM40O96008 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TOMM40O96008 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms