Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD3O95983 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD3O95983 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD3O95983 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD3O95983 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD3O95983 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD3O95983 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD3O95983 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD3O95983 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MBD3O95983 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MBD3O95983 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MBD3O95983 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MBD3O95983 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MBD3O95983 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MBD3O95983 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MBD3O95983 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MBD3O95983 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MBD3O95983 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MBD3O95983 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MBD3O95983 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MBD3O95983 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MBD3O95983 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MBD3O95983 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MBD3O95983 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MBD3O95983 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MBD3O95983 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MBD3O95983 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MBD3O95983 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MBD3O95983 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MBD3O95983 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MBD3O95983 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MBD3O95983 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MBD3O95983 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MBD3O95983 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MBD3O95983 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MBD3O95983 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MBD3O95983 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MBD3O95983 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MBD3O95983 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MBD3O95983 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD3O95983 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD3O95983 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD3O95983 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD3O95983 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD3O95983 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD3O95983 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD3O95983 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD3O95983 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD3O95983 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD3O95983 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD3O95983 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD3O95983 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD3O95983 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD3O95983 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD3O95983 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD3O95983 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MBD3O95983 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD3O95983 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD3O95983 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD3O95983 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD3O95983 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD3O95983 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD3O95983 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD3O95983 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD3O95983 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD3O95983 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD3O95983 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD3O95983 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD3O95983 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD3O95983 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD3O95983 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD3O95983 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD3O95983 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD3O95983 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD3O95983 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD3O95983 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MBD3O95983 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD3O95983 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD3O95983 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD3O95983 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD3O95983 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD3O95983 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD3O95983 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD3O95983 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD3O95983 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD3O95983 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD3O95983 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD3O95983 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD3O95983 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD3O95983 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD3O95983 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD3O95983 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD3O95983 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD3O95983 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD3O95983 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD3O95983 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD3O95983 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD3O95983 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD3O95983 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MBD3O95983 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms