Protein–RNA interactions for Protein: O95696

BRD1, Bromodomain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD1O95696 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BRD1O95696 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRD1O95696 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRD1O95696 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRD1O95696 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRD1O95696 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRD1O95696 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRD1O95696 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRD1O95696 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRD1O95696 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRD1O95696 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRD1O95696 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRD1O95696 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRD1O95696 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRD1O95696 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRD1O95696 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRD1O95696 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRD1O95696 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRD1O95696 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRD1O95696 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRD1O95696 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BRD1O95696 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRD1O95696 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRD1O95696 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRD1O95696 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRD1O95696 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRD1O95696 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRD1O95696 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRD1O95696 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRD1O95696 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRD1O95696 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRD1O95696 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
BRD1O95696 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRD1O95696 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRD1O95696 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRD1O95696 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRD1O95696 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRD1O95696 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRD1O95696 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRD1O95696 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRD1O95696 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRD1O95696 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BRD1O95696 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BRD1O95696 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRD1O95696 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRD1O95696 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRD1O95696 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BRD1O95696 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRD1O95696 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BRD1O95696 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRD1O95696 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRD1O95696 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRD1O95696 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BRD1O95696 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRD1O95696 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BRD1O95696 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
BRD1O95696 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BRD1O95696 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
BRD1O95696 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
BRD1O95696 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BRD1O95696 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BRD1O95696 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRD1O95696 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRD1O95696 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRD1O95696 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BRD1O95696 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BRD1O95696 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BRD1O95696 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BRD1O95696 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BRD1O95696 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BRD1O95696 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRD1O95696 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRD1O95696 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRD1O95696 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRD1O95696 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRD1O95696 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRD1O95696 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRD1O95696 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRD1O95696 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRD1O95696 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRD1O95696 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRD1O95696 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRD1O95696 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRD1O95696 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRD1O95696 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRD1O95696 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRD1O95696 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRD1O95696 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BRD1O95696 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRD1O95696 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRD1O95696 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRD1O95696 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRD1O95696 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRD1O95696 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRD1O95696 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BRD1O95696 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRD1O95696 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRD1O95696 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRD1O95696 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BRD1O95696 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms