Protein–RNA interactions for Protein: O75564

JRK, Jerky protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JRKO75564 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
JRKO75564 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
JRKO75564 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
JRKO75564 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
JRKO75564 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
JRKO75564 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
JRKO75564 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
JRKO75564 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
JRKO75564 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
JRKO75564 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
JRKO75564 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
JRKO75564 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
JRKO75564 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
JRKO75564 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
JRKO75564 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
JRKO75564 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
JRKO75564 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
JRKO75564 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
JRKO75564 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
JRKO75564 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
JRKO75564 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
JRKO75564 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
JRKO75564 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
JRKO75564 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
JRKO75564 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
JRKO75564 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
JRKO75564 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
JRKO75564 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
JRKO75564 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
JRKO75564 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
JRKO75564 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
JRKO75564 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
JRKO75564 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
JRKO75564 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
JRKO75564 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
JRKO75564 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
JRKO75564 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
JRKO75564 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
JRKO75564 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
JRKO75564 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
JRKO75564 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
JRKO75564 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
JRKO75564 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
JRKO75564 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
JRKO75564 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
JRKO75564 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
JRKO75564 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
JRKO75564 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
JRKO75564 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
JRKO75564 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
JRKO75564 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
JRKO75564 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
JRKO75564 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
JRKO75564 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
JRKO75564 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
JRKO75564 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
JRKO75564 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
JRKO75564 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
JRKO75564 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
JRKO75564 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
JRKO75564 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
JRKO75564 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
JRKO75564 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
JRKO75564 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
JRKO75564 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
JRKO75564 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
JRKO75564 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
JRKO75564 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
JRKO75564 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
JRKO75564 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
JRKO75564 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
JRKO75564 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
JRKO75564 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
JRKO75564 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
JRKO75564 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
JRKO75564 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
JRKO75564 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
JRKO75564 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
JRKO75564 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
JRKO75564 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
JRKO75564 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
JRKO75564 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
JRKO75564 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
JRKO75564 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
JRKO75564 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
JRKO75564 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
JRKO75564 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
JRKO75564 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
JRKO75564 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
JRKO75564 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
JRKO75564 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
JRKO75564 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
JRKO75564 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
JRKO75564 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
JRKO75564 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
JRKO75564 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
JRKO75564 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
JRKO75564 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
JRKO75564 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
JRKO75564 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms