Protein–RNA interactions for Protein: O75390

CS, Citrate synthase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSO75390 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSO75390 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSO75390 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSO75390 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CSO75390 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSO75390 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CSO75390 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSO75390 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CSO75390 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSO75390 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSO75390 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSO75390 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CSO75390 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSO75390 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSO75390 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSO75390 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CSO75390 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSO75390 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSO75390 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSO75390 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSO75390 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSO75390 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSO75390 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSO75390 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSO75390 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CSO75390 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSO75390 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CSO75390 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSO75390 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSO75390 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSO75390 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSO75390 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSO75390 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSO75390 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CSO75390 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSO75390 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSO75390 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSO75390 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSO75390 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSO75390 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSO75390 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSO75390 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSO75390 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSO75390 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSO75390 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSO75390 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CSO75390 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSO75390 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSO75390 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSO75390 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSO75390 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSO75390 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSO75390 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSO75390 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSO75390 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CSO75390 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSO75390 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSO75390 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSO75390 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CSO75390 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSO75390 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSO75390 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSO75390 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSO75390 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSO75390 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CSO75390 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSO75390 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSO75390 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSO75390 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSO75390 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSO75390 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSO75390 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSO75390 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSO75390 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSO75390 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CSO75390 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSO75390 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSO75390 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSO75390 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSO75390 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSO75390 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSO75390 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSO75390 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSO75390 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSO75390 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSO75390 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSO75390 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSO75390 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSO75390 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSO75390 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSO75390 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSO75390 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSO75390 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSO75390 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSO75390 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSO75390 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSO75390 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSO75390 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSO75390 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSO75390 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
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