Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX3O75364 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX3O75364 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX3O75364 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX3O75364 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX3O75364 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX3O75364 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX3O75364 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX3O75364 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX3O75364 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX3O75364 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX3O75364 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PITX3O75364 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX3O75364 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX3O75364 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX3O75364 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX3O75364 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX3O75364 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX3O75364 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX3O75364 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX3O75364 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX3O75364 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX3O75364 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX3O75364 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX3O75364 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX3O75364 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX3O75364 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX3O75364 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX3O75364 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX3O75364 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX3O75364 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX3O75364 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX3O75364 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX3O75364 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX3O75364 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX3O75364 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX3O75364 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX3O75364 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX3O75364 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX3O75364 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX3O75364 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PITX3O75364 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITX3O75364 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITX3O75364 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITX3O75364 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITX3O75364 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITX3O75364 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITX3O75364 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITX3O75364 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITX3O75364 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITX3O75364 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITX3O75364 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITX3O75364 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PITX3O75364 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITX3O75364 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITX3O75364 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PITX3O75364 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PITX3O75364 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITX3O75364 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITX3O75364 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITX3O75364 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITX3O75364 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITX3O75364 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITX3O75364 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITX3O75364 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PITX3O75364 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITX3O75364 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITX3O75364 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITX3O75364 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PITX3O75364 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITX3O75364 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITX3O75364 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITX3O75364 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITX3O75364 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITX3O75364 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITX3O75364 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITX3O75364 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITX3O75364 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITX3O75364 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITX3O75364 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITX3O75364 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITX3O75364 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITX3O75364 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITX3O75364 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITX3O75364 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITX3O75364 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITX3O75364 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PITX3O75364 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX3O75364 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX3O75364 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX3O75364 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX3O75364 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX3O75364 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX3O75364 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX3O75364 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX3O75364 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX3O75364 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX3O75364 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX3O75364 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PITX3O75364 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms