Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PPFIA4O75335 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPFIA4O75335 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms