Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
TIMM17BO60830 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TIMM17BO60830 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TIMM17BO60830 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TIMM17BO60830 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TIMM17BO60830 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TIMM17BO60830 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TIMM17BO60830 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TIMM17BO60830 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TIMM17BO60830 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TIMM17BO60830 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TIMM17BO60830 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TIMM17BO60830 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TIMM17BO60830 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TIMM17BO60830 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TIMM17BO60830 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TIMM17BO60830 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TIMM17BO60830 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TIMM17BO60830 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TIMM17BO60830 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TIMM17BO60830 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TIMM17BO60830 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TIMM17BO60830 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
TIMM17BO60830 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TIMM17BO60830 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TIMM17BO60830 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
TIMM17BO60830 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TIMM17BO60830 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
TIMM17BO60830 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
TIMM17BO60830 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms