Protein–RNA interactions for Protein: O60494

CUBN, Cubilin, humanhuman

Predictions only

Length 3,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUBNO60494 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUBNO60494 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUBNO60494 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUBNO60494 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUBNO60494 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CUBNO60494 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CUBNO60494 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUBNO60494 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUBNO60494 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUBNO60494 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CUBNO60494 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUBNO60494 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUBNO60494 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUBNO60494 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUBNO60494 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUBNO60494 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUBNO60494 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUBNO60494 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUBNO60494 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUBNO60494 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUBNO60494 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUBNO60494 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUBNO60494 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CUBNO60494 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUBNO60494 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUBNO60494 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUBNO60494 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUBNO60494 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUBNO60494 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUBNO60494 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUBNO60494 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CUBNO60494 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUBNO60494 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CUBNO60494 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUBNO60494 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUBNO60494 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUBNO60494 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUBNO60494 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUBNO60494 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUBNO60494 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUBNO60494 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUBNO60494 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUBNO60494 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUBNO60494 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUBNO60494 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUBNO60494 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUBNO60494 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUBNO60494 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUBNO60494 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUBNO60494 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CUBNO60494 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUBNO60494 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUBNO60494 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CUBNO60494 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUBNO60494 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUBNO60494 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUBNO60494 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUBNO60494 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUBNO60494 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUBNO60494 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUBNO60494 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUBNO60494 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUBNO60494 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUBNO60494 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CUBNO60494 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUBNO60494 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUBNO60494 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CUBNO60494 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CUBNO60494 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUBNO60494 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUBNO60494 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CUBNO60494 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUBNO60494 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUBNO60494 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUBNO60494 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CUBNO60494 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CUBNO60494 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUBNO60494 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUBNO60494 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUBNO60494 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUBNO60494 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUBNO60494 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUBNO60494 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUBNO60494 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUBNO60494 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUBNO60494 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUBNO60494 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUBNO60494 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUBNO60494 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUBNO60494 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUBNO60494 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUBNO60494 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUBNO60494 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUBNO60494 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUBNO60494 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CUBNO60494 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUBNO60494 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUBNO60494 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CUBNO60494 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CUBNO60494 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms