Protein–RNA interactions for Protein: O60449

LY75, Lymphocyte antigen 75, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY75O60449 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LY75O60449 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LY75O60449 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LY75O60449 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LY75O60449 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LY75O60449 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LY75O60449 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LY75O60449 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LY75O60449 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LY75O60449 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LY75O60449 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LY75O60449 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LY75O60449 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LY75O60449 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LY75O60449 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LY75O60449 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LY75O60449 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LY75O60449 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LY75O60449 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LY75O60449 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LY75O60449 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LY75O60449 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LY75O60449 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LY75O60449 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LY75O60449 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LY75O60449 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LY75O60449 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LY75O60449 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LY75O60449 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LY75O60449 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LY75O60449 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LY75O60449 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LY75O60449 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LY75O60449 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LY75O60449 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LY75O60449 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LY75O60449 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LY75O60449 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LY75O60449 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LY75O60449 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LY75O60449 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LY75O60449 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LY75O60449 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LY75O60449 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LY75O60449 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LY75O60449 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LY75O60449 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LY75O60449 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LY75O60449 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LY75O60449 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LY75O60449 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LY75O60449 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LY75O60449 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LY75O60449 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LY75O60449 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LY75O60449 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
LY75O60449 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
LY75O60449 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LY75O60449 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
LY75O60449 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LY75O60449 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LY75O60449 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LY75O60449 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LY75O60449 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LY75O60449 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LY75O60449 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LY75O60449 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LY75O60449 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LY75O60449 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LY75O60449 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LY75O60449 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LY75O60449 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LY75O60449 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LY75O60449 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LY75O60449 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LY75O60449 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LY75O60449 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LY75O60449 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LY75O60449 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LY75O60449 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LY75O60449 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LY75O60449 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LY75O60449 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LY75O60449 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LY75O60449 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LY75O60449 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LY75O60449 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LY75O60449 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LY75O60449 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LY75O60449 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LY75O60449 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LY75O60449 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LY75O60449 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LY75O60449 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LY75O60449 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LY75O60449 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LY75O60449 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LY75O60449 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LY75O60449 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LY75O60449 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms