Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMARCA5O60264 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMARCA5O60264 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms