Protein–RNA interactions for Protein: O60238

BNIP3L, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3LO60238 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BNIP3LO60238 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms