Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DHX16O60231 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DHX16O60231 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DHX16O60231 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DHX16O60231 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DHX16O60231 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DHX16O60231 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DHX16O60231 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DHX16O60231 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DHX16O60231 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DHX16O60231 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
DHX16O60231 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
DHX16O60231 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DHX16O60231 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DHX16O60231 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DHX16O60231 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DHX16O60231 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
DHX16O60231 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
DHX16O60231 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DHX16O60231 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DHX16O60231 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DHX16O60231 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DHX16O60231 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DHX16O60231 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DHX16O60231 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DHX16O60231 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DHX16O60231 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DHX16O60231 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DHX16O60231 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DHX16O60231 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DHX16O60231 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DHX16O60231 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DHX16O60231 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DHX16O60231 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DHX16O60231 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DHX16O60231 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DHX16O60231 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DHX16O60231 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DHX16O60231 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DHX16O60231 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DHX16O60231 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DHX16O60231 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DHX16O60231 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DHX16O60231 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DHX16O60231 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DHX16O60231 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DHX16O60231 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DHX16O60231 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DHX16O60231 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DHX16O60231 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DHX16O60231 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DHX16O60231 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DHX16O60231 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DHX16O60231 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DHX16O60231 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DHX16O60231 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DHX16O60231 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DHX16O60231 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DHX16O60231 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DHX16O60231 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DHX16O60231 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DHX16O60231 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DHX16O60231 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DHX16O60231 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DHX16O60231 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DHX16O60231 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DHX16O60231 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DHX16O60231 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DHX16O60231 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DHX16O60231 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DHX16O60231 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DHX16O60231 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DHX16O60231 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DHX16O60231 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DHX16O60231 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DHX16O60231 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DHX16O60231 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DHX16O60231 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DHX16O60231 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DHX16O60231 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DHX16O60231 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DHX16O60231 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DHX16O60231 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DHX16O60231 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DHX16O60231 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DHX16O60231 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DHX16O60231 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DHX16O60231 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DHX16O60231 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DHX16O60231 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DHX16O60231 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DHX16O60231 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DHX16O60231 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DHX16O60231 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DHX16O60231 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DHX16O60231 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DHX16O60231 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DHX16O60231 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DHX16O60231 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DHX16O60231 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms