Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SYNGR2O43760 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SYNGR2O43760 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms