Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DENRO43583 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DENRO43583 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DENRO43583 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
DENRO43583 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
DENRO43583 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
DENRO43583 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DENRO43583 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
DENRO43583 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DENRO43583 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DENRO43583 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
DENRO43583 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DENRO43583 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DENRO43583 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DENRO43583 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DENRO43583 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DENRO43583 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DENRO43583 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DENRO43583 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DENRO43583 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DENRO43583 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DENRO43583 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DENRO43583 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DENRO43583 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DENRO43583 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DENRO43583 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DENRO43583 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DENRO43583 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DENRO43583 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DENRO43583 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DENRO43583 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DENRO43583 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DENRO43583 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DENRO43583 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DENRO43583 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DENRO43583 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DENRO43583 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DENRO43583 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DENRO43583 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DENRO43583 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DENRO43583 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DENRO43583 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DENRO43583 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DENRO43583 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DENRO43583 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DENRO43583 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DENRO43583 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DENRO43583 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DENRO43583 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DENRO43583 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DENRO43583 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DENRO43583 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DENRO43583 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DENRO43583 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DENRO43583 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DENRO43583 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DENRO43583 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DENRO43583 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DENRO43583 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DENRO43583 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DENRO43583 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DENRO43583 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DENRO43583 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DENRO43583 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DENRO43583 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DENRO43583 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DENRO43583 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DENRO43583 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DENRO43583 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DENRO43583 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DENRO43583 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DENRO43583 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DENRO43583 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DENRO43583 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DENRO43583 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DENRO43583 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DENRO43583 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DENRO43583 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DENRO43583 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DENRO43583 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DENRO43583 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DENRO43583 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DENRO43583 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DENRO43583 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DENRO43583 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DENRO43583 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DENRO43583 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DENRO43583 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DENRO43583 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DENRO43583 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DENRO43583 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DENRO43583 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DENRO43583 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DENRO43583 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DENRO43583 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DENRO43583 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DENRO43583 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DENRO43583 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DENRO43583 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DENRO43583 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms