Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGSM2O43147 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SGSM2O43147 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGSM2O43147 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGSM2O43147 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGSM2O43147 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGSM2O43147 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SGSM2O43147 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SGSM2O43147 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGSM2O43147 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGSM2O43147 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGSM2O43147 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SGSM2O43147 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGSM2O43147 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGSM2O43147 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGSM2O43147 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGSM2O43147 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGSM2O43147 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGSM2O43147 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGSM2O43147 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGSM2O43147 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SGSM2O43147 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGSM2O43147 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGSM2O43147 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGSM2O43147 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGSM2O43147 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGSM2O43147 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGSM2O43147 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGSM2O43147 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGSM2O43147 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGSM2O43147 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGSM2O43147 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGSM2O43147 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGSM2O43147 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGSM2O43147 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGSM2O43147 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGSM2O43147 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGSM2O43147 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGSM2O43147 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGSM2O43147 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGSM2O43147 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGSM2O43147 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SGSM2O43147 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGSM2O43147 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SGSM2O43147 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGSM2O43147 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGSM2O43147 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGSM2O43147 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGSM2O43147 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGSM2O43147 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGSM2O43147 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGSM2O43147 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGSM2O43147 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGSM2O43147 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGSM2O43147 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGSM2O43147 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGSM2O43147 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGSM2O43147 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGSM2O43147 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGSM2O43147 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SGSM2O43147 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SGSM2O43147 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SGSM2O43147 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SGSM2O43147 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SGSM2O43147 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SGSM2O43147 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SGSM2O43147 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms