Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
POLR1CO15160 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
POLR1CO15160 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms