Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYNMO15061 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYNMO15061 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYNMO15061 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYNMO15061 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SYNMO15061 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYNMO15061 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYNMO15061 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYNMO15061 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYNMO15061 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYNMO15061 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYNMO15061 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYNMO15061 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYNMO15061 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYNMO15061 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYNMO15061 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYNMO15061 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYNMO15061 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYNMO15061 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYNMO15061 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYNMO15061 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYNMO15061 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYNMO15061 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYNMO15061 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYNMO15061 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SYNMO15061 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SYNMO15061 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SYNMO15061 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYNMO15061 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYNMO15061 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYNMO15061 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYNMO15061 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SYNMO15061 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYNMO15061 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYNMO15061 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SYNMO15061 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SYNMO15061 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SYNMO15061 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SYNMO15061 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SYNMO15061 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SYNMO15061 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SYNMO15061 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SYNMO15061 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SYNMO15061 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SYNMO15061 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SYNMO15061 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SYNMO15061 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SYNMO15061 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SYNMO15061 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SYNMO15061 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SYNMO15061 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SYNMO15061 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SYNMO15061 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SYNMO15061 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SYNMO15061 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SYNMO15061 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SYNMO15061 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SYNMO15061 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYNMO15061 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYNMO15061 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SYNMO15061 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYNMO15061 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SYNMO15061 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYNMO15061 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SYNMO15061 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYNMO15061 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYNMO15061 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SYNMO15061 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYNMO15061 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYNMO15061 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYNMO15061 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYNMO15061 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYNMO15061 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYNMO15061 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYNMO15061 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYNMO15061 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SYNMO15061 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SYNMO15061 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYNMO15061 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYNMO15061 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYNMO15061 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYNMO15061 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYNMO15061 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SYNMO15061 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYNMO15061 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYNMO15061 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYNMO15061 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SYNMO15061 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SYNMO15061 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SYNMO15061 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYNMO15061 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYNMO15061 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYNMO15061 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYNMO15061 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYNMO15061 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYNMO15061 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SYNMO15061 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYNMO15061 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYNMO15061 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYNMO15061 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms