Protein–RNA interactions for Protein: O15034

RIMBP2, RIMS-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMBP2O15034 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIMBP2O15034 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIMBP2O15034 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIMBP2O15034 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIMBP2O15034 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIMBP2O15034 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RIMBP2O15034 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIMBP2O15034 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIMBP2O15034 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIMBP2O15034 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIMBP2O15034 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIMBP2O15034 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIMBP2O15034 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIMBP2O15034 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIMBP2O15034 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIMBP2O15034 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIMBP2O15034 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RIMBP2O15034 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIMBP2O15034 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIMBP2O15034 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIMBP2O15034 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIMBP2O15034 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIMBP2O15034 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIMBP2O15034 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIMBP2O15034 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIMBP2O15034 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIMBP2O15034 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIMBP2O15034 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIMBP2O15034 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIMBP2O15034 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIMBP2O15034 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIMBP2O15034 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIMBP2O15034 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIMBP2O15034 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIMBP2O15034 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RIMBP2O15034 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIMBP2O15034 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RIMBP2O15034 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIMBP2O15034 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIMBP2O15034 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIMBP2O15034 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIMBP2O15034 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIMBP2O15034 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIMBP2O15034 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIMBP2O15034 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIMBP2O15034 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIMBP2O15034 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIMBP2O15034 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIMBP2O15034 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIMBP2O15034 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIMBP2O15034 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIMBP2O15034 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIMBP2O15034 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIMBP2O15034 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIMBP2O15034 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIMBP2O15034 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIMBP2O15034 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIMBP2O15034 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIMBP2O15034 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RIMBP2O15034 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIMBP2O15034 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIMBP2O15034 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIMBP2O15034 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIMBP2O15034 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIMBP2O15034 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RIMBP2O15034 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms