Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
EBAG9O00559 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EBAG9O00559 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EBAG9O00559 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EBAG9O00559 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EBAG9O00559 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EBAG9O00559 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EBAG9O00559 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EBAG9O00559 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EBAG9O00559 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EBAG9O00559 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
EBAG9O00559 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EBAG9O00559 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EBAG9O00559 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EBAG9O00559 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EBAG9O00559 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EBAG9O00559 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EBAG9O00559 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EBAG9O00559 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EBAG9O00559 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EBAG9O00559 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
EBAG9O00559 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
EBAG9O00559 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EBAG9O00559 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
EBAG9O00559 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EBAG9O00559 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
EBAG9O00559 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
EBAG9O00559 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EBAG9O00559 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
EBAG9O00559 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
EBAG9O00559 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
EBAG9O00559 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EBAG9O00559 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
EBAG9O00559 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
EBAG9O00559 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EBAG9O00559 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
EBAG9O00559 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EBAG9O00559 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
EBAG9O00559 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EBAG9O00559 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
EBAG9O00559 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EBAG9O00559 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EBAG9O00559 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
EBAG9O00559 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
EBAG9O00559 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
EBAG9O00559 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
EBAG9O00559 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
EBAG9O00559 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EBAG9O00559 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EBAG9O00559 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EBAG9O00559 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EBAG9O00559 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EBAG9O00559 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EBAG9O00559 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EBAG9O00559 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EBAG9O00559 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EBAG9O00559 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EBAG9O00559 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EBAG9O00559 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EBAG9O00559 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EBAG9O00559 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
EBAG9O00559 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EBAG9O00559 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EBAG9O00559 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EBAG9O00559 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EBAG9O00559 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
EBAG9O00559 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
EBAG9O00559 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EBAG9O00559 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EBAG9O00559 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EBAG9O00559 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
EBAG9O00559 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
EBAG9O00559 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms