Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLRMTO00411 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLRMTO00411 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLRMTO00411 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLRMTO00411 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLRMTO00411 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLRMTO00411 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLRMTO00411 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
POLRMTO00411 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
POLRMTO00411 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
POLRMTO00411 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms