Protein–RNA interactions for Protein: A8K830

COLCA2, Colorectal cancer-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLCA2A8K830 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
COLCA2A8K830 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms