Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PALM3A6NDB9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms