Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSDA5PKW4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PSDA5PKW4 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms