Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1B3

TRBV30, T-cell receptor beta variable 30 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV30A0A0K0K1B3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
TRBV30A0A0K0K1B3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRBV30A0A0K0K1B3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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