Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 HOXA-AS3-202ENST00000518947 3992 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 NT5C1B-201ENST00000304081 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 HRH1-203ENST00000431010 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SETD4-206ENST00000399212 3258 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TRUB1-201ENST00000298746 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TRPM8-201ENST00000324695 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RNF170-206ENST00000527424 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 LIAS-222ENST00000640888 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 FOXP1-212ENST00000491238 2250 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PDP2-201ENST00000311765 7146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RPS6KA2-211ENST00000510118 5992 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 DNA2-208ENST00000551118 3468 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RBM15-201ENST00000369784 4244 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PRDX2-202ENST00000334482 784 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SYNGR4-201ENST00000344846 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR339-201ENST00000362153 94 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PARP1-201ENST00000366790 570 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SPRR2D-204ENST00000368758 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR632-201ENST00000385193 94 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 DGKA-202ENST00000394147 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SKP137-201ENST00000411074 307 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TIMM8AP1-201ENST00000419283 295 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM86FP-202ENST00000427893 829 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL18AP15-201ENST00000430258 517 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PLA2G6-210ENST00000435484 612 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PRRX2-AS1-201ENST00000440413 429 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AOAH-IT1-201ENST00000449672 573 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 IP6K2-222ENST00000450045 689 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL33P-201ENST00000462543 342 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AL928742.1-201ENST00000497397 548 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 MYL5-205ENST00000505477 584 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 CHCHD10-204ENST00000520222 384 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 AC246817.2-201ENST00000523971 577 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 OR10V2P-201ENST00000525296 764 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 BAK1P2-201ENST00000532665 631 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 PRH1-204ENST00000539853 837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
KRTAP4-12Q9BQ66 WBP2NL-210ENST00000543212 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.4 ms