Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 CCDC63-204ENST00000552694 1651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 MAS1-201ENST00000252660 9841 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 AC023818.2-201ENST00000623817 2304 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 AC036214.3-201ENST00000522938 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 KIF15-201ENST00000326047 4842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 AP002001.1-202ENST00000525797 1754 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 TRIM55-202ENST00000315962 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 HLF-210ENST00000575345 3589 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 NUTM2B-AS1-212ENST00000610681 4241 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 AC104162.1-201ENST00000430831 2382 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 CAST-202ENST00000325674 3356 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 MTIF2-203ENST00000394600 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 OR10A2-202ENST00000641461 5390 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 NUP98-202ENST00000355260 5628 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 RAPGEF5-201ENST00000344041 6621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 TCF12-206ENST00000543579 1809 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 TLR3-202ENST00000504367 2310 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 AC135178.2-201ENST00000582471 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 DLG2-211ENST00000426717 5927 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 AC026464.2-201ENST00000567834 2421 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 DPY19L3-202ENST00000392250 5998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 AMZ2-206ENST00000577985 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 TMEM217-201ENST00000336655 1546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 OR2A42-202ENST00000641810 4946 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 RN7SKP257-201ENST00000364525 309 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 AC012451.1-201ENST00000412312 357 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 CHN2-208ENST00000412711 2991 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 AC007384.1-202ENST00000417026 891 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 RPSAP1-201ENST00000421328 880 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 AL121885.2-201ENST00000440255 819 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 GHRL-210ENST00000449238 440 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 AC108868.2-201ENST00000451464 511 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 AL450263.1-202ENST00000453199 643 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 OR51A1P-201ENST00000511110 946 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 AC114940.1-201ENST00000512162 1265 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 RNU6-943P-201ENST00000516960 98 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 AC023595.1-201ENST00000536216 564 ntTSL 4 BASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 ATP5J2P4-201ENST00000538774 267 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 COX6CP11-201ENST00000555293 229 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 AC015914.1-201ENST00000558050 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 AC006335.3-201ENST00000613408 292 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 CCL4L2-212ENST00000615418 954 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 AC026316.3-201ENST00000497988 3097 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 NPIPB11-201ENST00000524087 3653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 MRPS18C-201ENST00000295491 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 NFAT5-201ENST00000349945 13362 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 MYLK-206ENST00000418370 7282 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 WASF5P-205ENST00000428639 1455 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 AC145138.1-201ENST00000512908 2851 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 LINC00954-202ENST00000449086 2995 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 APOOL-203ENST00000622540 6466 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 PRDM2-201ENST00000235372 7957 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 ART4-201ENST00000228936 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 CD46-201ENST00000322875 3278 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 CD46-207ENST00000367041 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 OR4F15-201ENST00000332238 2119 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 NUDT13-202ENST00000357321 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 GPR1-AS-201ENST00000623040 3708 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 C14orf37-201ENST00000267485 6495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 AC061975.7-201ENST00000592016 2692 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
BHMTQ93088 SIRPB1-205ENST00000381605 3241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms