Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 MTERF4-222ENST00000614476 4524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 XRCC6P5-201ENST00000435236 1795 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 PLAC4-201ENST00000623119 5588 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 SERPINB13-201ENST00000269489 3206 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 NHSL1-204ENST00000427025 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 FAM71F1-209ENST00000621392 1591 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 CCNE2-202ENST00000396133 1361 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 GUCY1A3-202ENST00000393832 4286 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 LTBP1-207ENST00000418533 5164 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 HTATIP2-207ENST00000532081 774 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 MTRNR2L12-201ENST00000600213 1049 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AL353626.1-201ENST00000613429 507 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 ORAI2-201ENST00000356387 10811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 IYD-201ENST00000229447 7513 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AMOTL1-203ENST00000433060 8970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 RPL7L1-201ENST00000304734 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC245047.1-201ENST00000433276 873 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC022415.1-202ENST00000486612 523 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 TDP1-213ENST00000555880 1894 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 NFATC2-201ENST00000371564 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 DRP2-203ENST00000402866 7018 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 NDRG3-203ENST00000373773 2098 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 OR5T2-202ENST00000641661 2062 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 POU6F1-202ENST00000389243 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 DLC1-202ENST00000316609 1837 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 TRIM51HP-202ENST00000530412 1823 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AL133230.1-201ENST00000431019 4587 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 CC2D2A-202ENST00000424120 5249 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 MICAL2-203ENST00000379612 6625 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 PPIP5K1-203ENST00000360135 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 PPIP5K1-204ENST00000360301 5565 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 TTC28-201ENST00000397906 11795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 LIN54-202ENST00000442461 4254 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AL049650.1-201ENST00000461548 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 LINC00534-203ENST00000523406 812 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 CCNT2-202ENST00000295238 4491 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 PLEKHA5-201ENST00000299275 4238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 TNRC6A-201ENST00000315183 8303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 PRKG1-204ENST00000373985 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 RNF145-209ENST00000520638 2340 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 PPP6R3-214ENST00000527403 4862 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 PRPF8-201ENST00000304992 7295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 ASCC1-201ENST00000317126 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 ZNF217-201ENST00000302342 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 STAMBP-203ENST00000394073 6386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 VNN3-202ENST00000367927 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 FCF1-201ENST00000341162 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 RGPD2-201ENST00000398146 6931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 TNIK-201ENST00000284483 4059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 ACSL5-201ENST00000354273 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 EOGT-201ENST00000295571 4138 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
HERC1Q15751 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
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