Protein–RNA interactions for Protein: P28360

MSX1, Homeobox protein MSX-1, humanhuman

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSX1P28360 HMGN1P32-201ENST00000441744 256 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
MSX1P28360 GAGE12J-201ENST00000442437 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
MSX1P28360 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
MSX1P28360 AC084809.2-201ENST00000444464 512 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
MSX1P28360 FANK1-AS1-201ENST00000445458 428 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
MSX1P28360 HMGB1P16-201ENST00000447155 540 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
MSX1P28360 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
MSX1P28360 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
MSX1P28360 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
MSX1P28360 PAQR9-AS1-202ENST00000493825 576 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
MSX1P28360 AC008799.1-201ENST00000495909 457 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
MSX1P28360 AL031073.1-201ENST00000503029 1139 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
MSX1P28360 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
MSX1P28360 AC025437.1-201ENST00000523820 346 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
MSX1P28360 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC7.46□□□□□ -1.22
MSX1P28360 PFDN5-211ENST00000550846 392 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
MSX1P28360 PFDN5-214ENST00000551018 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
MSX1P28360 SRMP2-201ENST00000553832 916 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
MSX1P28360 AL358332.1-201ENST00000555649 813 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
MSX1P28360 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
MSX1P28360 HERC2P5-201ENST00000562687 3825 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
MSX1P28360 AC022165.1-201ENST00000568771 596 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
MSX1P28360 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
MSX1P28360 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
MSX1P28360 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
MSX1P28360 LAMTOR5-AS1-205ENST00000587691 441 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
MSX1P28360 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
MSX1P28360 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
MSX1P28360 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
MSX1P28360 PCGEM1-202ENST00000606314 759 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
MSX1P28360 AC099811.5-201ENST00000617211 819 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
MSX1P28360 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
MSX1P28360 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
MSX1P28360 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
MSX1P28360 RHOXF1P2-201ENST00000635431 502 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
MSX1P28360 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
MSX1P28360 AL139254.2-202ENST00000641937 1156 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
MSX1P28360 ASH1L-202ENST00000392403 10979 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
MSX1P28360 MS4A10-201ENST00000308287 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
MSX1P28360 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
MSX1P28360 TMEM108-203ENST00000508711 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
MSX1P28360 HCG18-244ENST00000602516 2890 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
MSX1P28360 C11orf88-203ENST00000529167 3099 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
MSX1P28360 KIAA0753-207ENST00000572370 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
MSX1P28360 SNTG1-207ENST00000522124 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
MSX1P28360 TMEM87A-202ENST00000389834 3109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
MSX1P28360 QRSL1P1-201ENST00000400977 1540 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
MSX1P28360 AGL-201ENST00000294724 7446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
MSX1P28360 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
MSX1P28360 SULT1C2-201ENST00000251481 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
MSX1P28360 INSIG2-201ENST00000245787 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
MSX1P28360 ZNF708-201ENST00000356929 4004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
MSX1P28360 KPNA6-201ENST00000373625 7378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
MSX1P28360 KLHL8-208ENST00000512111 3245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
MSX1P28360 AC009135.2-201ENST00000624136 1768 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
MSX1P28360 FBXO38-201ENST00000296701 3680 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
MSX1P28360 TIMD4-201ENST00000274532 1369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
MSX1P28360 DNAJC5B-201ENST00000276570 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
MSX1P28360 RABGEF1-203ENST00000439720 3065 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
MSX1P28360 BRD8-202ENST00000254900 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
MSX1P28360 LINC00467-201ENST00000423222 3508 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
MSX1P28360 TFRC-203ENST00000420415 4814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
MSX1P28360 AF228730.7-203ENST00000641436 1804 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MSX1P28360 SND1-IT1-201ENST00000623342 2481 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MSX1P28360 ETS1-204ENST00000526145 3389 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MSX1P28360 POLR1B-204ENST00000417433 3836 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MSX1P28360 MRPL22-206ENST00000522038 3162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MSX1P28360 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MSX1P28360 OSBPL6-202ENST00000315022 2999 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MSX1P28360 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
MSX1P28360 AC119674.1-202ENST00000641333 1860 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MSX1P28360 ZNF407-207ENST00000582337 5662 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MSX1P28360 HEATR4-201ENST00000334988 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
MSX1P28360 TOGARAM2-201ENST00000379558 12691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MSX1P28360 SIAH3-201ENST00000400405 7057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
MSX1P28360 GPM6B-201ENST00000316715 3275 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MSX1P28360 AP002358.1-201ENST00000399003 2805 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MSX1P28360 FMO10P-201ENST00000455032 1493 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MSX1P28360 C8orf37-201ENST00000286688 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
MSX1P28360 OR1J4-201ENST00000340750 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MSX1P28360 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
MSX1P28360 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MSX1P28360 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MSX1P28360 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MSX1P28360 AC096664.1-201ENST00000393996 778 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MSX1P28360 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
MSX1P28360 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MSX1P28360 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MSX1P28360 ZEB2-AS1-201ENST00000421083 453 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MSX1P28360 CDC42P6-201ENST00000421246 576 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MSX1P28360 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MSX1P28360 AC245014.1-201ENST00000427732 381 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MSX1P28360 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MSX1P28360 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MSX1P28360 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MSX1P28360 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MSX1P28360 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
MSX1P28360 AP006216.1-201ENST00000439104 419 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MSX1P28360 AL450472.1-201ENST00000439434 405 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
MSX1P28360 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
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