Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 AL035417.2-201ENST00000603887 796 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 SNORD96A-201ENST00000606577 79 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 AKAP7-201ENST00000263050 2238 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 SLC2A3P2-201ENST00000331747 1480 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 SUN3-201ENST00000297325 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 EEF1A1P16-201ENST00000325349 1414 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 AC004014.2-201ENST00000623718 5122 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 RPL7-201ENST00000352983 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 HMGN2-201ENST00000361427 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 PKIB-203ENST00000368446 556 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 HOPX-204ENST00000381260 1141 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 PDCL3P5-201ENST00000398028 722 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 RPL12P10-201ENST00000413498 498 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 AL359633.1-201ENST00000421403 310 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 ETDB-202ENST00000426364 388 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 ETDA-201ENST00000427686 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 AC006026.3-201ENST00000454029 143 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 ETDA-202ENST00000454551 388 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 RN7SL492P-201ENST00000460700 295 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 AC092903.2-201ENST00000510244 427 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 AZIN1-AS1-211ENST00000520455 480 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 SETP17-201ENST00000534163 817 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 LINC02413-201ENST00000549914 723 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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CXCL3P19876 AC011193.2-201ENST00000582638 367 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 MIR4428-201ENST00000584884 73 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 LINC02028-206ENST00000593326 810 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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CXCL3P19876 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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CXCL3P19876 AC004839.1-201ENST00000610269 501 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 AL121782.1-201ENST00000611242 413 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 AC140479.4-205ENST00000636339 820 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 LINC00682-204ENST00000637677 931 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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CXCL3P19876 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 VNN3-203ENST00000392393 1603 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 CCDC18-AS1-205ENST00000421202 2973 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 OR2A3P-202ENST00000641249 1776 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 TCF12-214ENST00000559710 1314 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 TMEM202-201ENST00000341689 1012 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 SPRR2D-202ENST00000368756 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 RNA5SP176-201ENST00000390956 110 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 NPPA-AS1-201ENST00000400892 936 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 FTH1P26-201ENST00000406512 701 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CXCL3P19876 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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