Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AC091167.5-201ENST00000605689 894 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 SNORA16A-202ENST00000628458 135 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AL596218.1-201ENST00000634239 1140 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 USP16-203ENST00000399975 2960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 GPR1-209ENST00000612892 2565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 EEF1A1P12-201ENST00000443590 1346 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 CACNB4-223ENST00000636380 1756 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 GCNT2-201ENST00000265012 4214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 TAS2R42-201ENST00000334266 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 SNORA38B-201ENST00000363524 131 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 ECHDC1-202ENST00000368289 909 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 OR2A2-201ENST00000408979 1051 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 RPL7AP14-201ENST00000424041 802 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AC023794.2-201ENST00000504891 528 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 A2MP1-201ENST00000543404 1201 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 RPL3P13-201ENST00000550415 216 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AC080011.1-201ENST00000552378 989 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AC090826.1-203ENST00000569235 490 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 ZNF486-202ENST00000597083 734 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AC120349.1-201ENST00000599498 282 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AP000577.1-201ENST00000624366 878 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 TEX41-255ENST00000626404 610 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 NOSTRIN-209ENST00000458381 2535 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AKAP17BP-201ENST00000431706 2719 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 TPRG1-204ENST00000433971 2296 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 DHRS9-204ENST00000428522 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 LINC01505-203ENST00000435485 1686 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 LRRC37A15P-201ENST00000514785 1355 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 TRAF5-201ENST00000261464 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 SERHL2-204ENST00000407614 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AL139415.1-201ENST00000424862 352 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AC092865.3-201ENST00000425390 1026 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 CFAP58-AS1-201ENST00000435434 795 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AL355355.1-201ENST00000442900 793 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 GAPDHP33-201ENST00000443168 1013 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 RPL23AP68-201ENST00000480924 445 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AC245088.1-201ENST00000486508 384 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 CSNK1A1-207ENST00000515768 1098 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
LRRTM2O43300 AC009269.5-201ENST00000557800 755 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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